Sarah will unsere hilfe noch etwas länger in anspruch nehmen. Sie möchte ein Terranisches Forschungs Gebäude infiltrieren um dort mehr über das Ghost-projekt zu erfahren, um so an mehr macht zu gelangen. Dies ist kein Befehl vom Overmind aus, Kerrigan handelt hier von ganz alleine aus. Aber wir wissen dass der Overmind über ihr vorhaben bescheid weiß, denn kein Zerg kann den Willen des Overmind entgehen.

Mit neuen Kräften ausgestattet bemerkt Kerrigan, dass die Protoss schon seit einiger Zeit in der Nähe von Char hausen und sich versteckt halten. Sarah Kontaktiert einen dieser Templer, und zwar Tassadar. Nach eines kurzen Dialogs über Macht starten wir die offensive. Wir löschen jeden Protoss aus um auf Tassadar zu treffen, aber Kerrigan möchte ihre Macht testen, und verlang ein Duell mit Tassadar.
Tassadar willigt ein, aber bereits nach wenigen Sekunden stellte sich herraus das dies nicht Tassadar sondern lediglich ein Trugbild ist. Wir haben uns ziemlich verarschen lassen...

Auf Char zurückgekehrt erfahren wird das der Zerebrat Zasz tot ist. Es lässter Kerrigan darüber, dass er vom Overmind sowieso bald reincarniert wird, doch erfahren wir nun dass die Protoss eine möglichkeit gefunden haben Zerebraten endgültig den Garaus zumachen. Tassadars Ablenkung in der letzten Mission war ein voller Erfolg.
Nicht nur das die Protoss dem Schwar wahrlich gefährlich werden können, nun ergibt sich noch ein weiteres Problem: Zasz Brut verfällt ohne ihren kommandierenden Zerebrat in Amok, und attackiert ringsum alle anderen Zerg. Kerrigan und wir sollen ihnen einhalt gebieten.

Nachdem wir die Zasz-Brut vernichtet haben, und sich der Overmind erholt hat lässt er uns folgendes wissen: Die dunlen Templar haben eine ähnliche macht wie die des Overminds. Aus diesem grund können sie seine Immortalität gefährlich werden. Allerdings gab es einen netten Zwischenfall: als der Dunkle Templar Zeratul den Zerebraten Zasz eliminierte, gab es einen mentalen Link zwischen Zeratul und den Overmind.
Mit hilfe dieses kurzen Verschmelzen ihrer Gedanken erfuhr der Overmind den geheimen Aufenthaltsort der Protoss Hauptwelt Aiur. Der Schwarm bereitet sich nun vor Aiur direkt anzugreifen und unsere Erstgeborenen Brüder, die Protoss, zu vernichten.
Wir haben allerdings vorerst eine andere Aufgabe: mit Hilfe von Kerrigan sollen wir allen Dunklen Templer die Flucht von Char versperren und sie auslöschen. Immerhin stellen sie die einzige wahre Gefahr dem Schwarm gegenüber dar.

Zeratul und Tassadar sind leider entkommen, aber wir haben den Protoss großen Schaden zufügen können. Wir werden nun auf Aiur geschickt um dort die Khaydarin-Kristalle zu sichen. Denn der Overmind erfuhr damals als er die Schöpfer Xel'Naga assimilierte über die Macht dieser Kristalle. Sobalt einer dieser Kristalle gesichert ist, kann sich der Overmind und somit der gesammte Schwarm auf Aiur manifestieren.
Die Protoss sind zwar die mächtigsten Wesen der Schöpfung, aber sobald wir sie assimiliert haben wirden die Zerg ... ... Perfekt sein.

Fast haben wir es geschaft! es gibt nur noch eine Sache zu tun: Auf Aiur gibt es einen Tempel der älter ist als die Protoss. Er wurde von den Xel'Naga erschaffen und sobald wir die äußere Hülle des Tempels durchschlagen haben und den Khaydarin-Kristall in seine Mitte platziert haben kann die manifestation auf Aiur beginnen, und somit das Ende der Protoss und allen existenzen des Voids herforgerufen werden. FÜR DEN SCHWARM!
(Leider ist der Xel'Naga Tempel für die Protoss heilig und deshalb stark bewacht.)